Program Studi (Prodi) Pendidikan Matematika FMIPA UNY pada tahun 2020 telah memperolah Akreditasi dan Sertifikasi Internasional (ASIIN dan AUN-QA) serta Akreditasi Unggul dari BAN-PT pada tahun 2021. Oleh karena itu, untuk ketiga kalinya kegiatan Visiting Professor (VP) Inbond tahun 2022 telah dilakukan Prodi Pendidikan Matematika. Setelah Dr. Jose Hanham dari School of Education Western Sydney University, Australia dan Dr. Ouhao Chen dari Loughborough University, United Kingdom (UK), kegiatan VP terakhir adalah mendatangkan Prof. Milton Rosa and Prof.

Pada Jumat, 1 Oktober 2021, pengurus Jurusan Matematika, FMIPA Universitas Negeri Surabaya berkunjung ke FMIPA, Universitas Negeri Yogyakarta dengan tujuan untuk mendiskusikan implementasi kerja sama, khususnya dalam kerangka Merdeka Belajar - Kampus Merdeka. Prodi Pendidikan Matematika dari kedua kampus bersepakat untuk mempererat kolaborasi melalui program transfer kredit, joint-teaching, joint-research, dan joint-publication.

Prodi Pendidikan Matematika telah lama menjalin kerja sama dengan Universiti Pendidikan Sultan Idris, Malaysia. Kegiatan yang telah dilaksanakan antara lain, pertukaran mahasiswa untuk kegiatan akademik (transfer kredit) dan non-akademik (studi banding), benchmarking kurikulum, pertukaran dosen (visiting professor), dan penyelenggaraan konferensi.